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• Afterthedoublehelicalsegmentcodingforglucagonisdeterminedbydefiningboththetemplate
and coding strand, divide the sequence into 24-base pair segments and have different student
groups make as many of the pieces of the full DNA structure as possible. Glucagon has 29 amino
acids; therefore, 87 base pairs are required to code the entire protein. If start and stop codons are
added, the entire sequence will have 93 base pairs; therefore, four student groups should be able to
create the “gene” sequence. The entire glucagon “gene” may then be mounted as a twisted double
helix on the single piece of flexible tubing found in the K’NEX DNA, Replication and Transcription
Class Pack.
intrOductiOn
The amino acid sequences of many different proteins can be found on the Internet. The addresses
for several of these web sites are provided at the end of this lesson. Several well-known web sites
serve as repositories for sequences and structures of proteins that have been published by scientists
following strict “peer review” procedures that are designed to check the work for accuracy. Despite
the care taken to ensure the validity of published sequences, students may find several different
proposed DNA sequences and different amino acid sequences for a given protein such as glucagon.
This is because the same protein may have slightly different amino acid sequence in different animals.
Thus, the source of a protein or DNA sequence usually is listed with any sequence information that
is provided.
Although the “same” protein may vary somewhat in amino acid composition between species, the
composition never varies enough to totally interfere with the protein’s major function in the cell. For
example, hemoglobin, the protein that carries oxygen in your blood, will likely have slightly different
DNA sequences in the genomes of humans and pigs. Proteins with such homology between species
can sometimes, but not always, be switched between species and still remain functional.
Most proteins are very large. They may contain hundreds of amino acids formed from several
separate chains. The DNA coding sequences for these proteins may easily be over ten thousand
base-pairs long. For this reason, students should target small proteins, often called peptides, for
exercises suggested in this lesson. Glucagon is a good example of such a small protein or peptide.
creAte/Assess
• AftercreatingtheglucagonDNA,transcribetheDNAbacktomRNA,takingcaretorememberwhich
of the DNA strands is the coding and which is the template strand.
 • WhatvariationsarepossibleinboththeDNAandmRNAsequenceandwhy?
 • Whatotherpossibilitiesexist?
[Assessment Note: Teachers may use this as a lab practicum activity.]
LESSON 5
MODULE III: CODING, TRANSLATION, AND MUTATIONS
Figure 3: Possible student journal entry showing mRNA, template DNA and coding DNA sequences for glucagon.
888-ABC-KNEX
Education
®
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